1.พระยาวิสูตรสาครดิษฐ์
(กัปตันจอห์น บุช)
เจ้ากรม
พ.ศ. 2402 – 2434

2.นาวาโท พระยานาวาพลพยุหรักษ์
(ม.ร.ว.พิณ สนิทวงศ์)
เจ้ากรม
พ.ศ. 2439 – 2444

3.พระยาวิสูตรสาครดิษฐ์
(เทียน ประทีปะเสน)
เจ้ากรม
พ.ศ. 2444 – 2458

4.พระยาวิสูตรสาครดิษฐ์
(สาย โชติกเสถียร)
เจ้ากรม
พ.ศ. 2458 – 2472

5.พระยาสาครวิสัย
(ม.ล.เป้า อิศรางกูร ณ อยุธยา)
เจ้ากรม
พ.ศ. 2472 – 2475

6.พลเรือตรี พระยาศรยุทธเสนี
(ประแสร์ ประวาหะนาวิน)
เจ้ากรม
พ.ศ. 2475 – 21 ก.ย. 2477

7.นาวาเอก พระชำนาญนาวากล
(เนียม วัชรเสถียร)
รักษาราชการแทน อธิบดี
26 ก.ย. 2477 – 21 เม.ย. 2478

8.นาวาเอก หลวงสินธุสงครามชัย
(สินธุ กมลนาวิน)
รักษาราชการแทน อธิบดี
22 เม.ย. 2478 – 16 พ.ค. 2479

9.นาวาโท พระภารสมุทร์
(ฉุย นุติประภา)
อธิบดี
19 พ.ค. 2479 – 28 ม.ค. 2490

10.นาวาตรี หลวงตรณีณัติการ
(ต่า กาณจนจูฑะ)
รักษาราชการแทน อธิบดี
29 ม.ค. 2490 – 30 มิ.ย. 2492

11.นาวาเอก พระพิจารณ์กลจักร
(สวัสดิ์ พันธุมคุปต์)
อธิบดี
1 ก.ค. 2492 – 24 ม.ค. 2500

12.เรือเอก หลวงตรีกลรักษ์
(บุญนาค เทศวิศาล)
อธิบดี
19 ก.พ. 2500 – 1 ม.ค. 2501

13.พลเรือตรี เอกไชย อิศรางกูร ณ อยุธยา
อธิบดี
1 เม.ย. 2501 – 30 ก.ย. 2505

14.นาวาโท พร เดชดำรง
อธิบดี
3 พ.ย. 2505 – 2 พ.ค. 2506

15.เรือเอก ประทีป พยอมยงค์
อธิบดี
3 พ.ค. 2506 – 30 ก.ย. 2509

16.เรือเอก บุญเลื่อน ซุ่นทรัพย์
อธิบดี
1 ต.ค. 2509 – 7 มี.ค. 2519

17.นาวาโท พิสิษฐ์ สุนสะธรรม
อธิบดี
8 มี.ค. 2519 – 26 ธ.ค. 2519

18.เรือเอก ประภา บูรณดิลก
อธิบดี
27 ธ.ค. 2519 – 30 ก.ย. 2521

19.พลเรือตรี ประกิจ ประจวบเหมาะ
อธิบดี
9 พ.ย. 2521 – 23 ต.ค. 2526

20.เรือเอก ลักษณ์ คเชนทร์ชัย
อธิบดี
24 ต.ค. 2526 – 30 ก.ย. 2527

21.นายอำพล ตียาภรณ์
อธิบดี
1 ต.ค. 2527 – 30 ก.ย. 2530

22.เรือเอก ชิต อ่องสุวรรณ
อธิบดี
1 ต.ค. 2530 – 30 ก.ย. 2532

23.นายอำพล ตียาภรณ์
อธิบดี
1 ต.ค. 2532 – 31 ส.ค. 2535

24.นายเสถียร วงศ์วิเชียร
อธิบดี
1 ก.ย. 2535 – 30 ก.ย. 2537

25.เรือโท วิทย์ วรคุปต์
อธิบดี
1 ต.ค. 2537 – 30 ก.ย. 2540

26.นายจงอาชว์ โพธิสุนทร
อธิบดี
1 ต.ค. 2540 – 30 ก.ย. 2543

27.เรือโท วิทย์ วรคุปต์
อธิบดี
1 ต.ค. 2543 – 18 เม.ย. 2544

28.นายวันชัย ศารทูลทัต
อธิบดี
1 ต.ค. 2544 – 30 ต.ค. 2547

29.นายถวัลย์รัฐ อ่อนศิระ
อธิบดี
1 ต.ค. 2547 – 14 ก.พ. 2550

30.นายประสงค์ ตันมณีวัฒนา
อธิบดี
14 ก.พ. 2550 – 31 ต.ค. 2551

31.นายชลอ คชรัตน์
อธิบดี
31 ต.ค. 2551 – 30 ก.ย. 2553

32.นายถวัลย์รัฐ อ่อนศิระ
อธิบดี
1 ต.ค. 2553 – 1 มิ.ย. 2555

33.นายจำรูญ ตั้งไพศาลกิจ
อธิบดี
3 ก.ค. 2555 – 1 ต.ค. 2555